يُرجَّح أنّ كنيسة مار الياس، في القعقور أنشئت في أوائل القرن التاسع عشر، إذ كانت رسامة الشمّاس جرجس مظلوم كاهناً لخدمة رعيّة القعقور في  ١٦ / ٠١ / ١٨٢٦ بوضع يد المطران عبدالله بيليبل. وربّما كان الخوري جرجس أوّل كاهنٍ لهذه الرعيّة. كان عدد السكّان قد ازداد، في هذه الفترة، فقَدَّمَ لهم أحد الأمراء اللمعيّين قطعة أرض، بَنَوا عليها كنيسةً صغيرة، ظَلَّت في استعمالهم حتّى أواخر القرن. دَخَلَها المخرّبون، في حوادث ١٨٦٠، وأشعلوا فيها النيران، وَطَعَنوا الصورة بحربة. ولكن ما أن انسحب المهاجمون حتى عاد الأهالي فأطفأوا النيران واصلحوا ما كان قد تضَرَّر، وأخذوا يفكّرون ببناء كنيسةٍ جديدة تفي بالحاجة. ويُقال إن الأهالي رفعوا جدران الكنيسة الجديدة حول الكنيسة القديمة التي ما لبثوا أن اعتلوا سطحها لعقد سقف الكنيسة الجديدة. ولمّا انتهى البناء الجديد هدموا الكنيسة القديمة. إستغرق العمل في بناء هذه الكنيسة حوالي عشر سنوات، وتَمَّ تدشينها سنة ١٨٨٦، كما يتبيّن ذلك من التاريخ المنقوش على بلاطةٍ رخاميّة، فوق الباب الغربيّ. إلى جانب الكنيسة، تقوم مدرسةٌ رعائيّةٌ تابعةٌ لمطرانيّة أنطلياس المارونيّة، كانت تديرها راهبات الورديّة .